Zelfstandige Gymnasia
De VRZG is de Vereniging van Rectoren van Zelfstandige Gymnasia. Het Praedinius Gymnasium maakt deel uit van het landelijke netwerk van gymnasia.

H.N.Werkman
Het Praedinius Gymnasium werkt met verschillende andere scholen samen. Met het H.N. Werkman College, de naburige centrumschool, worden al een aantal jaren verschillende vakken gezamenlijk aangeboden.

Een aantal personeelsleden is aan beide scholen verbonden. Ook hebben beide scholen samen een technieklokaal ingericht. Naast talloze informele contacten is er ook regelmatig directie-overleg.